RNT polimeraza nüvəsi ilə holoenzim arasındakı əsas fərq ondan ibarətdir ki, RNT polimeraza nüvəsi siqma faktoruna malik olmayan fermentdir, RNT polimeraza holoenzim isə siqma faktorundan ibarət fermentdir.
Bakteriyalarda transkripsiya bakterial DNT-nin bir seqmentinin RNT polimeraza fermentinin istifadəsi ilə yeni sintez edilmiş mRNT zəncirinə kopyalandığı prosesdir. Bu proses üç əsas mərhələdə baş verir: başlanğıc, uzanma və sonlanma. Bakterial RNT polimeraza 6 alt hissədən ibarətdir. RNT polimeraza nüvəsi β, β′, α2 və ω alt bölmələrindən ibarətdir. Bu RNT polimeraza nüvəsi σ (siqma) faktoru əsas fermentə bağlandıqda holoenzimə çevrilir. RNT polimeraza nüvəsi və holoenzim bakterial RNT polimeraza fermentinin iki formasıdır.
RNT Polimerase Core nədir?
RNT polimeraza nüvəsi siqma faktorundan azad olan bakteriya transkripsiyasında iştirak edən fermentdir. O, β, β′, α2 və ω kimi təyin edilmiş 5 alt bölmədən ibarətdir. Bu ferment bakterial və faj DNT promotorlarından spesifik transkripsiyaya başlamır. Bunun səbəbi heç bir xüsusi bakterial və ya faj DNT promotorlarını tanımamasıdır. Bununla belə, bu ferment RNT-ni qeyri-spesifik başlanğıc ardıcıllıqlarından transkripsiya etmək qabiliyyətini saxlayır. Üstəlik, bu fermentə siqma faktorunun əlavə edilməsi fermentə xüsusi bakterial və faq promotorlarından RNT sintezini başlamağa imkan verir. RNT polimeraza əsas fermentinin molekulyar çəkisi təxminən 400 kDa-dır.
Şəkil 01: RNT Polimeraz nüvəsi
Əsas ferment RNT polimerazanın katalitik xüsusiyyətlərini ehtiva edir. α alt bölməsi 36,5 kDa ölçüsündə olan homodimerdir. rpoA geni tərəfindən kodlanır. Bu alt bölmənin funksiyaları RNAP montajı, DNT ilə qarşılıqlı əlaqə və transkripsiya tənzimlənməsi üçün transkripsiya faktorlarıdır. Β alt bölməsi 150,4 kDa ölçüsündədir. rpoB geni ilə kodlanır. Bu alt bölmənin funksiyaları DNT və RNT-nin bağlanması, RNT sintezi, NTP bağlanması, RMP bağlanma yeri və σ faktorunun bağlanmasıdır. β' alt bölməsi 155 kDa ölçüsündədir və rpoC geni ilə kodlanır. Bu alt bölmənin funksiyaları DNT bağlaması, RNT sintezi, katalitik Mg2+ koordinasiya, ppGpp bağlama sahəsi 1 və σ faktorunun bağlanmasıdır. Bundan əlavə, ω faktoru 10,2 kDa ölçüsündədir və rpoZ geni ilə kodlanır. ω faktorunun funksiyası RNAP qatlama və ppGpp bağlama yeri 1-dir.
RNT Polimerase Holoenzyme nədir?
RNT polimeraza holoenzimi β, β′, α2 və ω subunitlərindən başqa siqma faktoru kimi tanınan spesifik komponentdən ibarətdir. Siqma faktoruna görə RNT polimeraza holoenzimi promotorları tanıya bilir. Siqma faktoru həmçinin RNT polimeraza holoenziminin düzgün yerləşdirilməsinə və başlanğıc yerində açılmasına kömək edir. Siqma faktoru tələb olunan və spesifik funksiyasını yerinə yetirdikdən sonra, RNT polimerazanın katalitik hissəsi (β, β′, α2 və ω) isə DNT-də qalır və transkripsiyanı davam etdirərkən, o, RNT polimeraza holoenzimindən ayrılır.
Şəkil 02: RNT Polimeraz Holoenzim
Siqma faktorlarının sayı bakteriya növləri arasında dəyişir. E. coli yeddi siqma faktoruna malikdir. Bundan əlavə, siqma amilləri xarakterik molekulyar çəkiləri ilə fərqlənir. Məsələn, σ70 molekulyar çəkisi 70 kDa olan siqma faktorudur. Müxtəlif ekoloji şəraitdə bakteriyalar tərəfindən müxtəlif siqma amillərindən istifadə edilir. Müxtəlif σ amillərinə misal olaraq; σ19, σ24, σ18, σ32, σ38 və σ54
RNT Polimeraz nüvəsi ilə Holoenzim arasında hansı oxşarlıqlar var?
- RNT polimeraza nüvəsi və holoenzim bakterial RNT polimeraza fermentinin iki formasıdır.
- Hər iki forma bakterial transkripsiyada iştirak edir.
- Onların alt bölmələri var.
- Onlar amin turşularından ibarət zülal molekullarıdır.
RNT polimeraza nüvəsi ilə holoenzim arasındakı fərq nədir?
RNT polimeraza nüvəsi siqma faktoruna malik olmayan fermentdir, RNT polimeraza holoenzimi isə siqma faktorundan ibarət fermentdir. Beləliklə, bu RNT polimeraza nüvəsi ilə holoenzim arasındakı əsas fərqdir. Bundan əlavə, RNT polimeraza nüvəsi əsasən transkripsiyanın uzanma mərhələsində iştirak edir, RNT polimeraza holoenzimi isə əsasən transkripsiyanın başlanğıc mərhələsində katalizləşdirir.
Aşağıdakı infoqrafika yan-yana müqayisə üçün RNT polimeraza nüvəsi ilə holoenzim arasındakı fərqləri cədvəl şəklində təqdim edir.
Xülasə – RNT Polimeraz nüvəsi ilə Holoenzim
Bakterial RNT polimeraza çox alt birlikli DNT-dən asılı fermentdir. Bakteriyaların transkripsiyasında iştirak edir. O, gen ifadəsinin əsas fermenti və tənzimləmə hədəfidir. RNT polimeraza nüvəsi və holoenzim bakterial RNT polimeraza fermentinin iki formasıdır. RNT polimeraz nüvəsində siqma faktoru yoxdur, RNT polimeraza holoenzimi isə siqma faktorundan ibarətdir. Beləliklə, bu, RNT polimeraza nüvəsi ilə holoenzim arasındakı fərqi ümumiləşdirir.
