Gen nokautu ilə nokaut arasındakı əsas fərq ondan ibarətdir ki, gen nokautu genin funksiyalarını öyrənmək üçün maraq doğuran genin tamamilə çıxarıldığı (işləməyən vəziyyət) bir texnikadır, gen yıxılması isə genin yıxıldığı başqa bir texnikadır. xüsusi genin bioloji sistemdəki rolunu araşdırmaq üçün maraq susdurulur.
Canlı bioloji sistemlər daxilində genlərin fəaliyyətini araşdırmaq üçün müxtəlif genetik üsullar fəaliyyət göstərir. Gen nokautu və yıxılması belə iki üsuldur. Bu üsullar alimlərə canlı orqanizmlərdə müxtəlif genlərin funksional tərəflərini müəyyən etməyə kömək edir.
Gen Knockout nədir?
Gen nokautu canlı orqanizmlərdə bir və ya bir neçə geni fəaliyyətsiz hala gətirən genetik texnikadır. Bu həm də orqanizmin geninin söndürülməsi və ya silinməsi prosesidir. Bu texnikanın əsas tətbiqi gen funksiyasını öyrənməkdir. Proses itirilmiş və ya çıxarılan genin təsirini qiymətləndirir. Nokaut prosesi həmçinin müəyyən fermentləri və birləşdirmə üsullarını əhatə edir.
Şəkil 01: Gen Nokautu
İştirak edən genlərin sayına əsaslanan gen nokaut texnikasında bir neçə dəyişiklik var. Bunlar ikiqat nokaut (iki genin nokautu), üçlü nokaut (üç genin nokautu) və dördlü nokautdur (dörd genin nokautu). Gen nokautu daha da iki qrupa təsnif edilir; heterozigot nokautlar və homozigot nokautlar.
Gen Knockdown nədir?
Gen yıxılması bu prosedurun orqanizmin müəyyən bir geninin və ya genlərinin ifadəsini sıxışdırdığı və ya az altdığı eksperimental prosedurdur. Gen susdurulması, gen yıxılmasının ümumi tərifidir. Bu prosedur zamanı istehsal edilən mRNT-nin aktivləşdirilməsi və ya deqradasiyası RNT müdaxiləsi (RNAi), kiçik müdaxilə edən RNT (siRNA) və qısa saç sancağı RNT (shRNA) daxildir.
Şəkil 02: Gen Susturulması
Gen yıxılmasının əsas istifadəsi xüsusi genin bioloji sistemdəki rolunu araşdırmaqdır. Buna görə də, bu texnika onkogenlərin (Bcl-2 və P53) və nevroloji xəstəliklərə, viral infeksiyalara və irsi xəstəliklərə səbəb olan genlərin öyrənilməsini həyata keçirir.
Gen Nakaut və Knockdown arasında hansı oxşarlıqlar var?
- Həm gen nokautu, həm də gen nokautu genetik üsullardır.
- Bu iki texnika gen ifadəsinin qarşısını ala bilər.
- Hər iki texnikanın əsas istifadəsi maraq doğuran genin funksiyasını araşdırmaqdır.
- Hər ikisi müxtəlif xəstəlik şərtlərini (genetik) müəyyən etməyə qadirdir.
- Onların hər ikisi maraq doğuran bir və ya daha çox gen üçün istifadə edilə bilər.
Gen nokaut və nokaut arasındakı fərq nədir?
Gene Knokaut vs Knockdown |
|
| Gen nokautu müxtəlif genetik üsullar vasitəsilə orqanizmin genlərinin işləməsidir (DNT-dən genlərin çıxarılması). | Gen yıxılması orqanizmin müəyyən bir geninin və ya genlərinin ifadəsini basdırmaq (az altmaq və ya susdurmaq) üçün eksperimental prosedurdur. |
| Funksiya | |
| İtirilmiş genin nəticələrini təhlil edərək genlərin funksiyalarının öyrənilməsini asanlaşdırır. | Onkogenlərin, nevroloji xəstəliklərə, viral infeksiyalara və irsi xəstəliklərə səbəb olan genlərin öyrənilməsini asanlaşdırır. |
| RNT Agentlərinin İştirakı | |
| RNT agentlərinin iştirakı bu texnikada əhəmiyyətsizdir. | Proses mRNA-nı təsirsiz hala gətirmək üçün siRNA, shRNT və RNTi kimi agentləri əhatə edir. |
| Kimyəvi maddələrin istifadəsi | |
| Enzimatik agentlər istifadə olunur. | Belə kimyəvi maddələr istifadə edilmir. |
| Gene təsiri | |
| DNT-dən geni tamamilə çıxarır. | Geni sıxışdırın və ya susdurun. |
| Təsnifat | |
| İkiqat nokaut, üçlü nokaut və dördlü nokaut və heterozigot və homozigot nokaut gen nokautunun müxtəlif növləridir. | Gen susdurmaq üçün belə təsnifat sistemi mövcud deyil. |
Xülasə – Gen Knokautu və Gen Knockdown
Burada müzakirə etdiyimiz iki texnika; gen nokautu və yıxılması, müxtəlif genlərin funksiyalarını araşdırmaq üsullarıdır. Gen nokautu geni tamamilə fəaliyyətsiz edir, gen nokaut isə maraq doğuran geni susdurur. Bununla belə, hər iki prosedur gen ifadəsinin qarşısını alır. Fərqli agentlər bu iki prosesi yerinə yetirməyə qadirdirlər. Gen nokautu bir silinmə növüdür, gen yıxılması isə bir növ inaktivasiyadır. Bu, gen nokaut və nokaut arasındakı fərqdir.
