Əsas Fərq – YAC vs BAC Vektorları
Vektorlar molekulyar klonlamada istifadə olunur. Bir vektor, yad genetik materialı başqa bir hüceyrəyə daşımaq üçün bir vasitə kimi davranan bir DNT molekulu kimi müəyyən edilə bilər. Tərkibində xarici DNT olan bir vektor rekombinant DNT kimi tanınır və onu ev sahibi orqanizmdə təkrarlamaq və ifadə etmək qabiliyyətinə malik olmalıdır. Maya süni xromosomu (YAC) və bakterial süni xromosom (BAC) klonlamada iştirak edən iki növ vektordur. YAC və BAC arasındakı əsas fərq ondan ibarətdir ki, YAC, maya hüceyrələrinə genetik materialların böyük seqmentlərini daxil etmək üçün maya xromosomunun müəyyən bir bölgəsindən istifadə edərək süni şəkildə qurulmuş vektor sistemidir, BAC isə müəyyən bir E.coli xromosomu DNT-nin böyük seqmentlərini E. coli hüceyrələrinə daxil etmək üçün.
YAC vektorları nədir?
YAC (Maya süni xromosomu) yad DNT-nin böyük bir seqmentini daşımaq və maya hüceyrələrinin içərisində çoxalmaq qabiliyyətinə malik olan süni şəkildə qurulmuş xromosomdur. Onun sentromer, telomerlər, eləcə də replikasiya və sabitlik üçün vacib olan avtonom şəkildə təkrarlanan ardıcıllıqları var. YAC həmçinin onu effektiv klonlaşdırma vektoru etmək üçün seçici marker və ya markerlər və məhdudlaşdırma saytları daşımalıdır. 1000 kb ilə 2000 kb arasında dəyişən böyük ardıcıllıq YAC-a daxil edilə və mayaya ötürülə bilər. YAC-ın transformasiya effektivliyi çox aşağıdır.
Şəkil 01: YAC Vector
BAC vektorları nədir?
Bakteriya süni xromosomu (BAC) molekulyar klonlama üçün süni şəkildə qurulmuş xromosomdur. E. coli F plazmidinin spesifik bölgələrinə malikdir və dairəvi və super qıvrımlıdır. BAC, DNT fraqmentlərini bakteriyalara, xüsusən də E. coli-yə klonlaşdırmaq üçün hazırlanmışdır. Ölçüləri 300 kb-a qədər olan DNT fraqmentlərini daşıya bilir. YAC ilə müqayisədə, BAC klonlama əlavələri ölçülərə görə daha kiçikdir. BAC-lar 1992-ci ildə hazırlanmışdır və sabitliyi və tikinti asanlığı səbəbindən hələ də populyardır. BAC-lər peyvəndlərin hazırlanmasında da faydalıdır.
Şəkil 02: Molekulyar klonlamada BAC vektoru
YAC və BAC vektorları arasında fərq nədir?
YAC vs BAC vektorları |
|
| YAC klonlama məqsədilə maya DNT-sindən istifadə edilən genetik mühəndislik xromosomudur. | BAC, klonlaşdırma məqsədilə E. coli DNT-dən istifadə edən genetik cəhətdən yaradılmış DNT molekuludur. |
| Cins | |
| YAC-lar genomik DNT-nin böyük fraqmentlərini mayaya klonlaşdırmaq üçün hazırlanmışdır. | BAC-lar böyük genomik fraqmentlərin Escherichia coli-yə klonlanması üçün hazırlanmışdır. |
| Daxiletmə Uzunluğu | |
| YAC-larda meqabaza ölçülü genomik əlavələr ola bilər.(1000 kb – 2000 kb). | BAC-lər 200–300 kb və ya daha az əlavələri daşıya bilər. |
| Tikinti | |
| YAC DNT-ni bütöv şəkildə təmizləmək çətindir və YAC vektor sistemi yaratmaq üçün yüksək konsentrasiya tələb olunur. | BAC-ni bütöv şəkildə təmizləmək asandır və asanlıqla tikilə bilər. |
| Kimerizm | |
| YAC-lar çox vaxt kimerik olur. | BAC-lər nadir hallarda kimerik olur. |
| Sabitlik | |
| YAC qeyri-sabitdir. | BAC sabitdir. |
| Modifikasiyalar | |
| Maya rekombinasiyası çox mümkündür və həmişə aktiv qalır. Beləliklə, o, YAC-da silmələr və digər tənzimləmələr yarada bilər. | E. coli rekombinasiyasının qarşısı alınır və lazım olduqda işə salınır. Beləliklə, o, BAC-lərdə arzuolunmaz yenidən tənzimləmələri azaldır. |
| Xidmət | |
| Rekombinant YAC-ların manipulyasiyası adətən sonrakı manipulyasiya üçün YAC-nin E.coli-yə köçürülməsini tələb edir. Beləliklə, bu, zəhmətli bir prosesdir. | BAC modifikasiyası birbaşa E. coli-də baş verir. Beləliklə, DNT transferinə ehtiyac yoxdur. Beləliklə, proses zəhmətli deyil. |
Xülasə – YAC vs BAC vektorları
YAC böyük DNT fraqmentlərini ev sahibi orqanizmə klonlaşdırmaq qabiliyyətinə görə klonlaşdırma proseslərində vacib tədqiqat vasitəsinə çevrilmişdir. Bununla belə, YAC-ların vektorlar kimi bir sıra çatışmazlıqları var, məsələn, tikinti çətinlikləri, kimerizm, qeyri-sabitlik və s. Buna görə də bu problemləri aradan qaldırmaq üçün alimlər BAC vektorlarını işləyib hazırlamışlar. BAC E. coli xromosomunun xüsusi bölgələrindən istifadə etməklə qurulmuşdur. Bu sabit vektordur və asanlıqla qurula bilər. Bununla belə, BAC-nin idarə edə biləcəyi DNT uzunluğu YAC-dan 20 dəfə azdır. Bu YAC və BAC vektor sistemləri arasındakı fərqdir. Hazırda laboratoriyalarda YAC-dan daha çox BAC-a üstünlük verilir.
