Transpozon vs Retrotranspozon
Transpozonlar və retrotranspozonlar DNT-nin genetik komponentləridir və onlar arasında əsas fərqlər var. Bu genetik materialların faiz mövcudluğu növlər arasında dəyişir və onların funksiyaları mutasiyalar və digər fenotipik əhəmiyyətli dəyişikliklərlə orqanizmin taleyini müəyyən edir. Transpozonlar və retrotranspozonlar DNT zəncirlərində yerləşən müəyyən genlərin genləri və ya kolleksiyalarıdır və onların yerlərinin dəyişməsi bu nəticələrin əsas səbəbləri olmuşdur. Bununla belə, bu məqalə bu genlərin funksiyalarını qısa şəkildə müzakirə etmək niyyətindədir və transpozonlar və retrotranspozonlar arasında müqayisə təqdim edir.
Transpozon nədir?
Transpozonlar DNT zəncirinin yerini kəsib-yapışdırma mexanizmi şəklində dəyişmək qabiliyyətinə malik maraqlı fraqmentlər və ya DNT seqmentləridir. Transpozonların bu mobil təbiətinə görə bunlar atlama genləri kimi tanınır. Transpozonlar Sinif I Transpozonlar və Sinif II Transpozonlar kimi tanınan iki əsas növdür. Adətən II sinif növünə transpozonlar, I sinfinə isə retrotranspozonlar deyilir. Mobil DNT seqmentlərinin kəsilməsi və yapışdırılması prosesləri transpozaza fermenti tərəfindən tənzimlənir. Ferment transpozonun hər iki ucuna bağlanır və DNT zəncirinin fosfodiester bağlarını kəsir, transpozonu təcrid edir, onu hədəf yerinə köçürür və yeni yerdə bağlanır. Bununla belə, bu prosesi başa düşmək maraqlıdır, çünki bəzi transpozonlar yalnız əsas ardıcıllığın hədəf sahə ilə uyğunsuzluğu səbəbindən yalnız müəyyən yerlərə keçə bilirlər. Tək zəncirinin bir ucu olan genlər digər tək zəncirinin digər ucu ilə eyni baza ardıcıllığına malikdirlər, yapışqan kənarları olan transpozonlardır, çünki onlar yapışqan uclarda olduğu kimi eyni əsas ardıcıllıqla hədəf DNT zəncirinin sahələrinə bağlana bilirlər.. Bununla belə, genlərin bu hərəkətliliyi orqanizmin fenotipində olduğu kimi genotipdə də dəyişikliklərə səbəb ola bilər. Transpozonlar və genetik cəhətdən dəyişdirilmiş qida və orqanizmlər haqqında icad edilən elm adamları daha sonra üstünlük verilən fərdiləşdirmələrə uyğun olaraq istifadəyə verildi. Yüksək məhsuldar kənd təsərrüfatı bitkiləri, dərman xassələri olan antibiotiklər, heyvandarlıq heyvanları 1940-cı illərdə Barbara Makklintok tərəfindən transpozonların ixtirasından sonra faydalı işlənmiş məhsullardan bəziləri idi.
Retrotranspozon nədir?
Retrotranspozonlar Sinif I transpozonlardır və bunlar kopyalama və yapışdırma mexanizmi vasitəsilə genomda hərəkət edir. Retrotranspozonların hərəkətlilik mexanizmi DNT zəncirinin gen seqmentinin RNT-yə kopyalanması, RNT nüsxəsinin hədəf yerə köçürülməsi, əks transkriptazadan istifadə edərək RNT ardıcıllığının DNT-yə yenidən transkripsiyası və daxil edilməsi kimi bir neçə əsas addımı əhatə edir. genomun DNT zəncirinin yeni yerində. Bu retrotranspozonların iki ucu adətən təxminən 1000 əsas cütü olan uzun terminal təkrarlarına malikdir və bunlar bu genlərin identifikasiya xüsusiyyətləri kimi istifadə olunur. Bu genlər genom daxilində asanlıqla gücləndirilir və insan genomunda retrotranspozonların faizi təxminən 50% təşkil edir. Bunlar olduqca təhlükəli ola bilər, çünki QİÇS, HİV və T-hüceyrəli leykemiya virusunun törədicisi RNT genomlarında retrotranspozonlara malikdir. Əslində, bu viruslar retrotranspozonları əks transkriptaza və inteqrazadan istifadə etməklə insan DNT zəncirlərinin istənilən yerinə bağlaya bilər. İnteqraza fermenti Sinif II transpozonlardakı transpoza ilə eyni şəkildə fəaliyyət göstərir.
Transpozon və Retrotranspozon arasındakı fərq nədir?
• Transpozonlar Sinif II sıçrayış genləridir, retrotranspozonlar isə I sinif kateqoriyasına aiddir.
• Transpozonlar transpozaza fermenti ilə, retrotranspozonlar isə əks transkriptaza və inteqraza kimi tanınan iki əsas fermentin istifadəsi ilə işləyir.
• Terminal ucları retrotranspozonlarda transpozonlara nisbətən daha uzundur.
• Transpozonlar mənşədən kəsilir və hədəfə yapışdırılır; əksinə, retrotranspozonlar mənşədən RNT-yə kopyalanır və hədəfdə transkripsiya edilir.
• Retrotranspozonların hərəkəti RNT-ni əhatə edir, lakin transpozonlarda deyil.
